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二区8.7分纯生信SCI,非肿瘤诊断标志物,基于GEO数据库包含机器学习免疫浸润,清清爽爽
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复现二区8.7分非肿瘤纯生信文章,再不上车来不及了,基于GEO数据库机器学习筛选特征基因,非肿瘤诊断标志物,生物信息学,可实验验证
37非肿瘤免疫浸润分析及可视化,GEO数据库,免疫浸润细胞分析
16GEO数据库limma包差异分析得火山图和热图,GEO数据库差异分析
单基因的免疫浸润分析,CIBERSORT方法
非肿瘤ceRNA调控网络,lncRNA-miRNA-lncRNA
生信富集分析,GO(BP,MF,CC),KEGG,功能富集分析的基因功能数据库及软件,生物信息
kegg和go富集分析,只有基因列表无logFC值,拒绝No gene can be mapped...
Cytoscape 绘图,相互作用网络显示了药物的核心生物靶点、药理功能和信号通路
GEO单基因的差异分析,批量绘制单基因差异图。生信分析判断基因差异性
03基因之间的相关性
教程,GWAS与eQTL相结合,进一步筛选疾病相关基因,肿瘤和非肿瘤都可,新方法筛选标志物
GEO,TCGA差异分析火山图标记感兴趣的基因,R画带标记基因的火山图
生信富集分析,只有基因列表无logFC差异倍数,进行GO(BP,MF,CC),KEGG功能富集分析,新冠基因为例
只需要一个mRNA,就能做cerna网络图。预测目标mrna基因结合的miRNA,mrna-mirna-lncrna
肿瘤单基因可做的生信分析,TCGA数据库肿瘤单基因分析
GEO数据库挖掘,非肿瘤疾病生物信息挖掘,精神分裂症举例
【未明子诊所】避免成为“孤绝者”
基于TCGA数据库,构建ceRNA(竞争性内源RNA),R语言下载数据,外部数据预测。生物信息
GEO数据整理,单独样本文件整理,RAW单独文件处理方法
从TCGA数据库中,筛选出和预后相关的所有基因。没有目标基因方法,找到新课题
纯生信,Q1区4.7分,失巢凋亡相关lncRNA的预后模型。可做细胞死亡/泛死亡/NK细胞/细胞衰老/线粒体等基因集,TCGA结合免疫浸润药物
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【文章全套教程】5分TCGA单基因生信分析思路,生信+实验,适用于SCI,中文核心,毕业论文,多文章分析单基因都可以做什么。单基因筛选和分析
【文章教程】免疫细胞孟德尔随机化分析,正反双向2图1区7分。
TCGA甲基化数据下载整理(乳腺癌为例,大小129G,TCGA官网下载)
构建ceRNA网络方法。ceRNA图。生物信息 mRNA-lncRNA-miRNA图
生信分析,TCGA数据库中,基因在乳腺癌分型的表达,TCGA三阴性乳腺癌数据
【教程】Q1区7.3分。孟德尔联合生信分析。 基于孟德尔随机化和转录组数据分析,探索非肿瘤在肿瘤中的因果关系和发病机制。
蛋白质、代谢等7种组学+3种机器学习+铁S亡,能发22+Nature子刊的生信挖掘发SCI思路
系统生物学讲座第十七期-Computational Brain Disorders: A panoramic study(冯建峰教授)
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01单基因和免疫检查点的相关性
TCGA数据库33种肿瘤临床数据分享,附下载地址,生信必备
GEO数据库单基因GSEA富集分析,生物信息
【文章全套教程】IF分4.2,非肿瘤and孟德尔随机化加持,基于GEO数据库的非肿瘤生信分析,WGCNA+孟德尔分析筛选疾病的关键基因
生物信息、纯生信文章。复原3分+的医学文章,缺氧免疫RBP铁死亡代谢等方向相关的lncRNA的预后模型分析
TCGA数据改版新版,新格式STAR - Counts,包含之前的count、fpkm数据,比老版本更好用,整理只需两步
生信文章SCI模型新思路,Q1区中科院2区8.7分,可做基因集(细胞死亡,失巢凋亡,细胞衰老,糖基化,反馈回路,乳酸代谢,焦亡等思路通路基因)TCGA多角度分析
TCGA,GEO等生信挖掘通用脚本,区分lncRNA和mRNA,区分蛋白和长链非编码RNA
TCGA数据库中筛选预后相关的基因,及单基因简单分析