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friendly2MR安装&PhenoScanner可视化去除混杂SNPs
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孟德尔随机化--如何安装friendly2MR_0.2.0
孟德尔随机化--去除具有混杂的工具变量
【教程完】双数据库做药物靶点孟德尔,本地数据。乳腺癌为例。eqtl+gwas训练+芬兰验证+药物分子对接+共定位+ PheWAS+蛋白互作PPI+富集分析
34共定位分析,GWAS-eQTL和药物靶点共定位,基因和疾病共定位,孟德尔
孟德尔随机化--friendly2MR新增函数使用教程
调用ANNOVAR对GWAS数据进行注释&添加SNP号
快速分子对接
孟德尔随机化--SNP插补eaf
11.Genetic Correlation Icpagdb
13.Genetic Correlation Ldsc
获取gtexV8eqtl数据
【云上GWAS】002大脑静息态孟德尔随机化详解及分析演示-高效分析快速出SCI
08.Hg19tohg38
共定位分析--IEU数据库中两个GWAS的共定位(coloc)分析
32.Predata Hyprcoloc
LDSC-hess-遗传相关性-孟德尔随机化(性状/疾病间的共同遗传研究)
38.Gene2func
24.phenoscanner
39.Ppi
09.Fuma
【云上GWAS】001脑脊液代谢组孟德尔随机化详解及分析演示-高效分析快速出SCI
08.heritability_ldsc
5分sci复现-网药结合孟德尔随机化-1收集
11.predata_lava
网药和smr取交集-gokegg-ppi-单个基因的smr
12.Predata Genetic Correlation Ldsc
30.Volcano Ukb-Ppp Decode
17.Mendelian Randomization Decode
14.MAGMA
12.heritability_lava
02.Software
10.Plot Fuma
UTMOST(跨组织转录组关联研究)+FUSION+FOCUS+MAGMA+孟德尔随机化
孟德尔随机化--初筛
23.Mendelian Randomization Ukb Ppp
07.Metal Gwas
06.Pre Data
5分sci复现-网药结合孟德尔随机化-4分子对接
34.Reverse Mendelian Randomization Decode
21.Colocalization Decode