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LinkedOmics数据库分析基因相关性
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linkedomics是一个TCGA二级数据库,不用R语言就可以分析,本期视频讲述的是基因之间相关性的预测。
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GO富集分析
GEO芯片数据下载和ID转换
step1_fastq文件清洗质控
KEGG富集分析
PLKO.1 shRNA设计与载体构建
GEO差异分析火山图绘制
GEO数据差异分析及单基因箱线图绘制
非模式生物做GO,KEGG富集分析
LNP介导的自复制RNA疫苗原理
GTF文件处理获取gene_name,gene_biotype
单细胞测序箱线图、比例图、热图、tsne差异基因表达量图绘制
ensembl_ID转换
按基因表达量和T细胞免疫浸润做生存分析
一个样本对应一个文件的GEO数据整理
harmony_数据整合及巨噬细胞亚群鉴定
下载KMplotter数据库利用prism作生存分析
step4_bam转化为bw在igv中可视化
GEO数据分析热图绘制
chipseq流程介绍
step7_画热图和profile图
oncomine数据下载并绘制箱图
step2_fastq比对得到sam文件_1
step6_streme_homer_call_motif
推荐一本书,留德十年(一加9r拍摄)
step5_macs2_callpeak
张祥前对老高视频的回应
单细胞测序处理_step0_绪论
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