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别再说纯生信想不出好思路了!北大深圳医院黄晓彦团队基于UKB数据库,孟德尔随机化一套连招拿下13分+!
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今天,小记者在PubMed里发现了一篇很有意思的纯生信分析,这篇文章的主要目的是探索肾功能和不良结局之间的关系,文章主要是运用了炙手可热的孟德尔随机化(MR)方法,结合了观察性分析中的COX回归、限制性立方样条等分析方法,充分利用了UKB数据库中的个体水平数据,分析了暴露与结局之间的因果关系。仅靠3张图拿下13分,快跟小记者一起来看看这篇文章里有哪些精彩思路吧。 文章的其精彩之处有以下几个方面: 1、文章基于UKB数据库,拥有庞大的样本量,再加上严谨的样本纳入排除标准,使得研究对象具有较好的代表性以及较高的质量。 2、文章使用了观察性分析+孟德尔随机化分析相结合的分析方法,对于在观察性中显著的结果,进一步通过遗传学分析进行验证,分析步骤之间环环相扣,由表及里,层层递进,思路严谨。 3、文章采用了线性+非线性结合分析的形式,是文章的首要创新所在,传统的孟德尔随机化分析只能从线性的角度检验因果关系,但实际情况往往并非如此,许多指标如微量元素等已被证明与人体健康状况之间存在非线性关系。作者在此通过线性+非线性结合验证的形式进行分析,排除了可能存在的非线性因果关系,扩展了文章脉络。内容如此丰富,思路如此严谨的生信分析,我们学到就是赚到呀!感兴趣的小伙伴赶紧码住学习! (ps:想了解更多生信分析思路,就来扫码联系小记者,这里有新鲜出炉的生信热点方向,还有一大波的可复现的创新思路哦~)
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