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克服网络问题完成GEO数据下载和ID转换
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使用GEOquery进行GEO数据下载和ID转换遇到网络问题,快来试试这个方法吧,清爽的八达鸟。 有需要这些代码或者代码的详细讲解的话找我啊,带你入门生信分析~~
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GEO测序数据的一般处理流程都在这里啦
一键完成多个数据集合并去批次PCA图箱线图
转录组数据分析-一键搞定GEO数据下载ID转换
一键完成GEO芯片数据分析,so easy
GEO数据分析--数据合并去除批次效应
转录组分析14-使用lasso+随机森林+svmrfe进行特征筛选
转录组分析16-超简单易懂的WGCNA分析实现
用shiny搭建的生信分析app又重出江湖了~
shinyapp更新了功能,可以获取msigdb数据库基因集并进行GSEA分析
转录组分析13-cibersort免疫浸润分析
转录组分析15-单因素cox分析多因素cox分析+森林图绘制
在shiny网页上绘制渐变色火山图
转录组分析09-一键搞定GO/KEGG/Reactome富集分析
转录组分析24-绘制cox模型的测试集校准曲线
转录组分析08-一键绘制差异基因热图
转录组分析0607-绘制火山图,并给显著的基因添加上label
R语言并行计算,试试furrr这个包,快到一骑绝尘~
转录组分析10-通路基因集的获取
对shinyapp生成的图自定义主题!
转录组分析18-生存分析
在shinyapp上绘制富集分析花瓣图
在shinyapp里面轻松绘制火山图
使用shinyapp进行RNA-seq数据的差异分析
在shinyapp上进行花瓣型韦恩图的绘制
转录组分析21-轻松绘制时间依赖的ROC曲线
转录组分析05-一个函数搞定DESeq2 edgeR limma差异分析
在shinyapp上进行韦恩图绘制
风险因子关联图绘制的模板代码
记录下WSL的安装美化和使用
转录组分析17-风险评分的计算
转录组分析20-轻松绘制多个ROC曲线于一张图
转录组分析23-cox-逻辑斯蒂-列线图
转录组分析19-风险因子关联图
一个用于生信分析的shiny app
在shinyapp上方便的进行通路基因集的获取(MSigDB GO KEGG Reactome)
TCGA单基因泛癌cox回归分析和森林图绘制
在shinyapp上方便的进行富集分析和可视化
转录组分析24-绘制逻辑斯蒂模型的测试集校准曲线
在shinyapp上进行GSEA分析
转录组分析12-GSEA分析