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4.1 SwissTargetPrediction获取主要成分基因(TCMSP数据)
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本视频介绍SwissTargetPrediction如何获取主要成分基因名,也接着3.视频的讲解。
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中药复方网络药理学:4. SwissTargetPrediction的使用
4.2 HERB数据主要成分基因获取的两种方式
在 TCMSP 找不到的中药怎么办:用 Herb 网站查找成分,再用Swiss Target 网站预测靶点
网络药理学第四篇——中药成分靶点预测(TCMSP、Swisstargetprediction、PharmMapper、GEO等数据库)
VEEN图及PPI网络的绘制(筛选关键靶点)
10.疾病-通路-靶点-成分-药物网络构建(Cytoscape)
Swiss Target Prediction成分靶点预测
摆脱复制粘贴 如何快速爬取TCMSP网站里的成分及靶点
9.2 GO,KEGG富集分析数据可视化气泡图(微生信)
疾病数据库的使用(OMIM,TTD,GeneCards)
网络药理学-Part2--中药成分靶点预测(SWISS、Pharmmapper)
中药复方网络药理学:9. 1 TCMSP找不到目标中药怎么办?(一)
如何使用cytoscape制作中药-成分-靶点网络关系图
网络药理学的整体思路及相关数据库的使用汇总
5. 疾病基因获取 (Disgenet数据库)
Similarity ensemble approach (SEA)成分靶点预测
UniProt ID 转化成基因名
网络药理学实际操作(1/2),包含数据处理,成分筛选,靶点处理。后续操作陆续会发,如有加急代做请联系主页微信~
12-tcmsp没有的药物成分该如何做呢?提供两个思路!
e嘉医 | 中药网络药理学:【11】专题二 药物靶点预测-SwissTargetPrediction
中药复方网络药理学:9.2 TCMSP平台找不到目标中药怎么办?(二)
8.3 Cytoscape构建药物-成分-靶点基因网络操作步骤(2)
PPI网络:蛋白互作网络的构建与核心基因的筛选(string数据库,cytoscape软件与cytoNCA插件)
SwissADME药代动力学属性预测
成分靶点预测方法(1) 之 基于TCMSP和uniport
TCMSP数据库搜索活性成分+活性成分靶点搜集。——所涉及到的数据库有:TCMSP, Pubchem, SwissTargetptrdiction
成分靶点预测方法(2) 之 Pub chem 结合Swiss Target Prediction预测靶点(可省去Target转Symbol步骤)
TCMSP数据库活性成分结构文件及SMILE号获取
GeneCards数据库获取疾病基因
快速爬取TCMSP并进行uniprot的ID转换
C21.药物靶点获取和整理TCMSP, Swiss Target Predic等【中药复方网络药理学(联合TCGA分子对接10分文章套路)】
简单好用的BATMAN-TCM数据库
2.1 根据Lipinsk五原则进一步成分筛选主要成分(herb数据)
自学网络药理学用 请勿收藏
6. 成分基因与疾病基因Venn图(Venny2.1,微生信)
网络药理学入门必备(实操快速完成本科网络药理学毕设)
中药复方网络药理学:8. 基于Cytoscape的复方成分-靶点网络基本调节与可视化
网络药理学1-中药活性成分的筛选
网络药理学-中药成分及靶点数据的收集
网络药理学 Part2--成分靶点数据的处理(SWISS、Pharmapper)数据的筛选和uniprot ID的转换