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【Materials Studio】氢键脚本2号:片段间氢键PDF概率分布函数,数量、键长、键角随时间变化,溶液、蛋白质、聚氨酯、矿物浮选、表面活性剂
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脚本获取方法在视频最后! 氢键②号脚本: 不但能给出氢键的数量,还能给出其随时间的变化! 不但能统计所有氢键的键长、键角,还能给出它们在每一个长度区间、角度区间的分布,直接画出图来,做进一步的分析! 不但能通过受主元素(如O、N、F)对氢键进行分类讨论,而且能区分片段内部(intra-set)与片段间(inter-sets)的氢键,还可以处理多个片段、组分的结构! 本期特训内容包括: ✅ 氢键判据(长度、角度)与润湿性 ✅ 气固、固液界面、液体、聚合物、煤分子建模与分子动力学模拟 ✅ 上述体系的氢键数量随时间的演化 ✅ 上述体系的各组分间的氢键平均长度随时间的演化 --------------------------二、三区分割线---------------------------- ✅ 组分间氢键长度、角度的Probability Distribution Function ✅ PMF (Potential of Mean Force)与Free energy landscape与PDF的联系 ✅ 表面活性剂、溶液、蛋白质、聚氨酯、矿物浮选
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MS氢键脚本-Materials Studio分子动力学:片段间氢键Hbond长度、角度、数量的概率分布函数PDF及随时间演化,固液界面,溶液,蛋白质,聚氨酯
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