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不会吧!还不知道tsRNA测序也能预测中药治疗疾病的靶点?一文带你了解一下
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tsRNA简介:一群由18~40个核苷酸的转移RNA(tRNA)切割而成的异质性小非编码RNA,命名为tRNA衍生的小RNA(tRNA-derived small RNAs, tsRNAs)。tsRNAs参与多种机制,如调节mRNA稳定性、翻译、rRNA合成和RNA逆转录。是蛋白质生物合成期间将氨基酸转运到核糖体的翻译机制的必要部分。目前,越来越多的新tsRNA被鉴定出来,它们在疾病中的作用和潜在机制不断被阐明。 今天要分享的文献,大致的思路如下(省流版本):在中药的研究中,对对照,模型和药物治疗组进行tsRNAs测序,随后进行差异tsRNA分析,筛选与药物治疗有关的tsRNA。随后,对这些tsRNA的靶点进行预测。这些靶点可能是中药治疗疾病的潜在作用靶点。最后,对这些靶点的功能等进行分析,进一步阐明药物治疗涉及的生物过程。 好啦,正式开始吧~ 文章题目:Systematic analysis of tRNA-derived small RNAs reveals therapeutic targets of Xuefu Zhuyu decoction in the cortexes of experimental traumatic brain injury [系统分析tRNA衍生的小RNA揭示血府逐瘀汤在实验性创伤性脑损伤皮质中的治疗靶点] 发表期刊:Phytomedicine [IF=6.656;1区] 实验设计:[分组]雄性SD大鼠按随机分为假手术组、创伤性脑损伤[TBI]组和血府逐瘀汤治疗[XFZYD]组。[病理学观察]通过Morris水迷宫、改良神经功能缺损评分、H&E染色和尼氏染色观察XFZYD的体内保护作用。[分子机制研究]应用tsRNA-seq分析大鼠皮层中tsRNA的表达。qRT-PCR验证4条tsRNAs。利用生物信息学技术研究了推测的tsRNAs的生物学功能。体外验证tsRNAs靶向mRNA的功能。
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