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R语言单细胞分析流程(多样本harmony整合去批次)
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很久之前做的分析,流程和网上的都差不多。还没准备就录制的,所以讲的比较快,中间找线粒体核糖体血红蛋白基因的百分比只是找到还没过滤(好久没看这个代码录制时没想起来),后半段讲了怎么过滤的。 视频里有讲一些学生信小技巧,一键三连啦! 单细胞其实困难的是细胞注释,每个人同样注释出来的细胞类型也许不一样,所以要参考很多文献来注释,下期可以讲下用cellmakers数据库来注释细胞,还算比较简单。 ps:用chatgpt辅助帮你读代码或者找代码超级好用。
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直播二GEO手把手处理数据,harmony去批次效应,获取最优聚类个数,提取某个亚群
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