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Windows下使用hmmer查找同源基因
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基因家族分析——InterPro查找保守结构域号-Pfam号(隐马尔可夫模型)
pfam下载结构域文件
Hmmer也可以自动化!零基础进行Hmmer自动化并提取ID与蛋白质序列
利用hmmer, pafm特定结构域在基因组中搜索genes
基因序列的查找(自存)
Hmmer自动化改进,只需要PF编号即可进行自动化hmmsearch、提取ID、提取蛋白质序列
利用TAIR网站BLAST工具查找拟南芥同源基因
2.前期文件的准备
4、比对,共线性, hmmer
如何利用biomaRt实现跨物种同源基因之间的转换
Blast多物种同源基因序列
生信都会用到哪些软件|软件教程集合|生物信息学
如何搜索同源基因和互作蛋白(自用版)
基因同源注释(组内交流)
常用生物信息软件
【文献阅读】拟南芥CLE3以及其同源基因通过CLV1/BAM1调控侧根生长 part1
植物基因组网站phytozome之blast工具使用
两分钟会用NCBI查找参考基因组
HMMER Fast and sensitive sequence similarity searches
科研神器-TBtools- 90分钟完全掌握基因家族分析~
3.基因家族成员的筛选鉴定
利用TBtools软件Find Best Homology工具在全基因组水平进行特定物种同源基因查找
概念:Homologs(同源基因)Orthologs(直系同源基因)Paralogs(旁系同源基因)
生物信息学—如何从NCBI下载物种的全基因组序列
#单个基因的生物信息学分析-5#互作蛋白?同源基因?轻松搞定!
蛋白质在不同物种间的同源性比对
粉丝答疑 + 如何运用“生物信息学”研究某个蛋白?——同源序列搜索
进化树分析
hmmer鉴定基因家族
【生物信息学】常用软件概论【实用版】
利用TBtools通过HMMER方法鉴定家族成员
使用pfam进行基因家族鉴定【生物信息学】
序列的同源性搜索与进化树的构建
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【干货】如何使用NCBI寻找基因DNA、mRNA及蛋白质序列【瞎说的】
基因家族分析基础入门实操
基因家族分析
使用blast比对同源性