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绘制单细胞的拟时序细胞分化轨迹,为不同分组细胞进行着色
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大家看了我整个单细胞分析流程的系统讲解视频+每个模块的实操讲解视频+每个模块的演示数据,这样下来基本上一天就能精通单细胞的全流程分析,并能快速用自己的单细胞测序数据或公共数据库下载的单细胞数据在自己的电脑上跑完单细胞分析的全部流程。 包括但不限于单细胞数据的全流程零代码一键分析软件神器OmicsTools在我的github仓库zihaoxingstudy1/OmicsTools仓库中大家可以下载安装进行各种生信分析和可视化作图。
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单细胞转录组分析细胞亚型注释整个流程的详细教程
1.3对每个分组总的细胞通讯可视化和lr贡献度可视化详细教程
可视化不同拟时序时间段的细胞类型或一些其它分组等的比例完整版
对基因表达或通路富集分数等特征进行高低分组
拟时序分析中时序基因的批量差异分析和筛选
读取Seurat注释好细胞名称的数据进行单细胞拟时序分析教学
细胞亚群的注释和makergene的展示
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提取出表达矩阵和样本分组信息中的子集数据
指定起始位置的细胞并进行拟时序时间计算和可视化
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绘制分组排序的条形图教程,代做生信分析和辅导
12种常见生信图解读,最后给大家整理了科研绘图资料,无偿分享给大家
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将整理的的细胞名称文件注释到seurat对象中并进行可视化教程和结果解读
P1-4 GEO数据挖掘论文复现每晚11点手把手直播教学视频,从GEO中下载表达矩阵和分组信息
对机器学习或深度学习的数据进行整理和预处理
有分组信息,特征变量映射为x轴,用分组信息填充颜色的百分比条形图
提取部分分组的seurat子集进行后续分析或细胞的亚型注释
对数据进行melt,把分组信息+样本id作为x轴类别名称,特征变量作为填充颜色的百分比条形图
从表达矩阵列名中匹配提取出分组信息
所有生信分析的R包我都 编译打包了一份,大家 下载到自已电脑上就可 以开箱即用了,能解决 各种R包安装失败问题
细胞比例在不同分组中的差异比较教程和结果解读