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《超越RNA速率:机器学习方法,dynamo,从单细胞测序数据学习完整细胞动》主讲人:邱肖杰(麻省理工学院博士后)#BioArt与一作面对面#组学篇
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主讲人简介:邱肖杰博士是麻省理工学院Whitehead研究所,美国科学院院士Jonathan Weissman 实验室的博士后研究员。他的工作专注于应用新的单细胞基因组学技术(包括新的基于代谢标记的单细胞测序或空间基因组学)和构建新的计算框架来了解细胞的命运,并预测和操纵它。肖杰在华盛顿大学,单细胞测序领域先驱Cole Trapnell的指导下攻读博士学位。肖杰的博士工作对单细胞基因组学领域做出了重大贡献,例如他开发的Monocle 2/3,可以准确、稳健地重建复杂的发育轨迹来深入分析scRNA-seq 数据。这些工具成为了单细胞测序领域用的最多的工具之一。与 Sreeram Kannan 密切合作,他还开发了 Scribe从单细胞时间序列数据集中检测直接因果关系的基因调控关系。他最近的工作包括与邢建华实验室紧密合作开发的dynamo(https://github.com/aristoteleo/dynamo-release)超越传统的计算框架单细胞的的预测建模细胞命运转变,以及与华大基因紧密合作对大视场,高精度空间基因组学的stere-seq建模研究。
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《哺乳动物大脑和神经系统疾病的单细胞表观基因组分析》主讲人:李洋(华盛顿大学医学院)#BioArt与一作面对面#组学篇
《单碱基对层面观测基因组高级结构》主讲人:华鹏(南京医科大学生殖医学国家重点实验室教授、博士生导师)#BioArt与一作面对面#组学篇