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iMeta: 俄亥俄州立大学郑庆飞组发表多组学方法研究肿瘤微生物组综述
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多组学方法在肿瘤微生物组研究中的应用 Applying multi-omics towards tumor microbiome research DOI: https://doi.org/10.1002/imt2.73 发表时间:2023/01/09 第一作者:Nan Zhang (张楠); 通讯作者:Qingfei Zheng (郑庆飞) Qingfei.Zheng@osumc.edu 合作作者:Shruthi Kandalai; Xiaozhuang Zhou (周小状); Farzana Hossain 主要单位: 美国俄亥俄州哥伦布市俄亥俄州立大学医学院放射肿瘤学系 美国俄亥俄州哥伦布市俄亥俄州立大学詹姆斯综合癌症中心癌症代谢中心 美国俄亥俄州哥伦布市俄亥俄州立大学医学院生物化学和药理学系 亮点 • 肿瘤微生物组在癌症发生、发展、转移和治疗中扮演着重要角色。 • 肿瘤微生物组具有成为癌症早期诊断和治疗靶标的巨大潜力。 • 多组学方法(基因组学、转录组学、蛋白质组学和代谢组学)是研究肿瘤微生物组的有力手段,促进了在中心法则不同水平的理解。 • 多组学将对肿瘤微生物组的未来研究产生巨大影响。 • 单细胞多组学技术的发展将推动肿瘤微生物组领域的进步。 摘要 肿瘤微生物群不是人体的“短期租户”,而是作为“永久居民”在癌症的发生、发展、转移和治疗中扮演着重要角色。由于肿瘤微生物组具有成为癌症早期诊断和治疗的靶标的巨大潜力,最近关于人类微生物组和癌症之间相关性的研究引起了各个科学领域的广泛关注,导致了受益于跨学科技术发展的显著进展。然而,在这一新兴领域仍然存在各种各样的挑战,例如肿瘤内细菌的低生物量和一些微生物物种的不可培养特性。由于肿瘤微生物组研究的复杂性(如肿瘤微环境的异质性),迫切需要具有高空间和时间分辨率的新方法。在这些发展中的方法中,多组学技术(基因组学、转录组学、蛋白质组学和代谢组学的组合)是强有力的方法,可以促进在中心法则的不同水平上理解肿瘤微生物组。因此,多组学(尤其是单细胞组学)将对未来微生物与肿瘤微环境相互作用的研究产生巨大影响。本文系统总结了多组学的研究进展及其在肿瘤微生物组研究中的现有和潜在应用,为研究者提供了一个可供参考的组学工具箱。 Nan Zhang, Shruthi Kandalai, Xiaozhuang Zhou, Farzana Hossain, Qingfei Zheng. 2023. Applying multi-omics toward tumor microbiome research. iMeta 2: e73. https://doi.org/10.1002/imt2.73
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