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11_nichenet数据库讲解
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单细胞/空间转录组数据分析的细胞互作/细胞通讯部分已全部更新完毕,共13个视频,约5小时,基本涵盖了这个领域的所有内容。视频先讲原理,再讲代码,由浅入深,如果觉得有用,可以给个三连!
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06_CellPhoneDB的上游代码讲解
12_nichenet用法的分步讲解(详细到爆)
CellPhoneDB的绘图与版本升级
13_nichenet的简易用法
nichenet的原理、nichenet能做什么分析
cellchat的原理、cellchat能做哪些分析
07_cellchat基础用法(一个condition)的代码详解
08_cellchat多组比较(多个condition)的代码详解
cellchat和nichenet的预告、细胞互作的几个问答
GO/KEGG富集分析
GSEA富集分析
10_cellchat用于空间转录组数据
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09_一个平平无奇的空间转录组流程
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76,单细胞文件整理矩阵文件,适用于包含barcodes.tsv.gz、features.tsv.gz 和 matrix.mtx.gz整理方法
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79单细胞分析,使用umap聚类,包括细胞注释,细胞通讯,基因标记,质量控制与标准化,高变异基因识别,主成分分析(PCA),UMAP降维与聚类分析,细胞类型注释
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