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地表最强 GFF3/GTF 文件操作讲演 ~ TBtools
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课程简介 本课程将通过一次直播,预计使用两个小时,完全介绍 TBtools 的 GFF3/GTF 文件操作菜单下 12 个功能的具体使用。 功能简介 GFF3/GTF Manipulate 覆盖了几乎所有常见的 基因结构注释信息文件操作功能: 1.GXF序列提取(如CDS,启动子) 2.GXF信息提取(如基因位置) 3.基于序列的GXF重新构建(矫正) 4.GXF mRNA 特征寻回 5.GXF ID 前缀增加 6.GXF 代表性转录本 ID 一键获取 7.GXF 代表性转录本全注释文件获取 8.GXF 区域截取 9.基于 ID 的 GXF 特征获取 10.GXF 文件修复(推荐~) 11.GXF 文件信息统计(外显子数目等) 12.基因密度统计 功能优势 1. 界面化,无需掌握或者记忆命令 2. 本地化软件,无需注册,一次掌握,终生可用 3. 跨平台,Windows,Mac OS,Linux 等均可使用 重点注意! 本录屏为两年前腾讯课堂放置课程视频,现公益开放,没有答疑售后。 按照个人经验,我的讲演,不需要售后。
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2.前期文件的准备
GTF文件处理获取gene_name,gene_biotype
生物信息基础-gff基因组注释文件格式
【TBtools】做基因家族之基因组下载与处理
TBtools的Blastp比对
测序 单细胞 课程 RNA-seq 生信分析 GFF FASTAQ
1.TBtools的下载
【TBtools】进行本地全基因组blast比对
0.NCBI下载基因组数据(GTF、GFF3、蛋白序列、CDS序列等)
【TBtools】做基因家族之基因结构分析
8、生物信息学中各种文件格式的转换
基因家族分析课程12,gff和基因组的提取,一步步讲解
P5【KEGG Pathway 通路富集分析】-分析实例 @微生物所张倩
深入理解热图绘制 - 第四课 | 实践操作part2
16-gtf文件信息提取
进化树+Motifs+Domains+基因结构,一键可视化
深入理解热图绘制 - 第三课 | 实践操作part1
「TBtools-RNAseq」界面化转录组数据分析使用指北-Part II
Tbtools学习3:一分钟将CDS序列文件转化成氨基酸序列
深入理解热图绘制 - 第五课 | 实践操作part3
【TBtools】做基因家族之理化性质分析和染色体定位
P4【基因功能注释】-GO KEGG PFAM @微生物所张倩
NCBI下载基因组和注释文件,TBtools转换成CDs和蛋白序列
基因家族分析课程26--GFF3文件提取,Linux实操,命令讲解
[TBtools]安装教程,附安装包及下载网址
Phytozome网站下载基因、蛋白质、CDS序列和注释文件
TBtools | 在「Windows」下界面化ChIPseq/DAPseq数据分析
TBtools学习2:一分钟提取自己想要的序列
3.基因家族成员的筛选鉴定
R语言 | 内含子信息提取 | 基于GFF注释文件
1.1.基因家族确定
【基因家族分析】2保守基序和结构域可视化
Fasta 序列文件处理完全教程~ 地表最强、宇宙最简 | TBtools
如何使用TBtools做基因家族分析 | 生信部分
#基因家族分析系列6#启动子分析!瞅一瞅基因参与了哪些活动
TBtools 转录组分析实操(从原始数据到筛选差异基因)
生物信息学分析:保守基序和基因结构分析
[TBtools最新版的安装]含安装教程、下载网址、最新安装包
「TBtools-RNAseq」界面化转录组数据分析使用指北-Part I
TBtools命令行批量GO富集分析