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主流分子可视化软件对原子间成键判断规则
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原子间是否成键判断方式有很多,最为正确的当然是根据本身已知分子的性质,化学环境判定。 在分子模拟领域可视化分子过程中,往往用户并不会直接提供原子正确的连接信息,此时需要可视化软件自行判断。这种情况下不同软件给出可能并非一致。 目前网上已有可参考的较为全面的资料: ①谈谈原子间是否成键的判断问题 (http://sobereva.com/414) ②谈谈VMD可视化程序的连接关系的判断和设置问题 (http://bbs.keinsci.com/thread-16396-1-1.html)
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