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30 WGCNA分析,加权基因共表达网络分析。筛选模块基因,生信分析
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WGCNA ,全称为weighted gene co-expression network analysis,即加权基因共表达网络分析。该分析方法旨在寻找协同表达的基因模块(module),并探索基因网络与关注的表型之间的关联关系,以及网络中的核心基因。 WGCNA主要有以下四个步骤: 第一步:构建基因网络; 第二步:分层聚类构建基因模块; 第三步:筛选关键模块 第四步:鉴定关键基因
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生信富集分析,GO(BP,MF,CC),KEGG,功能富集分析的基因功能数据库及软件,生物信息
构建ceRNA网络方法。ceRNA图。生物信息 mRNA-lncRNA-miRNA图
适用于本科硕士生信毕业论文,可代分析指导。基于TCGA数据库筛选结肠癌预后免疫相关lncRNA及预后风险模型的建立,肿瘤预后风险模型思路。
从TCGA数据库中,筛选出和预后相关的所有基因。没有目标基因方法,找到新课题
生物信息,生信文章,简单粗暴复现5分文章生信内容,非编码RNA结合临床预后生信分析思路,列线图差异分析ROC模型构建TCGA
适用于本科硕士生信毕业论文。肿瘤预后风险模型简单思路。基于TCGA数据库筛选结肠癌预后免疫lncRNA及预后风险的建立,【可做其它肿瘤和基因集】
GEO,TCGA差异分析火山图标记感兴趣的基因,R画带标记基因的火山图
03基因之间的相关性
R语言教学:如何完善全面的安装旧版本的 R 包(bioconductor、gihub、cran)
单细胞基本分析流程学习总结
数据取log2,表达值差别较大取LOG2,适用GEO,TCGA等,生信分析方法~
25分钟完成中文核心所有图和表,单基因单癌分析
生物信息、纯生信文章。复原3分+的医学文章,缺氧免疫RBP铁死亡代谢等方向相关的lncRNA的预后模型分析
kegg和go富集分析,只有基因列表无logFC值,拒绝No gene can be mapped...
38孟德尔随机化通过eQTL数据筛选疾病相关基因
Origin绘制弦图-生信分析图形绘制
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GEO数据库挖掘,非肿瘤疾病生物信息挖掘,精神分裂症举例
TCGA批量单基因差异分析并批量绘图
免费在线富集分析网站,GO、KEGG富集分析——DAVID与KOBAS在线分析工具
GEO数据下载及处理,史上最简单的方法,无代码,含gene symbol类型GPL570
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iMeta 重医大沈伟等发布全能序列处理工具SeqKit2
11GEO数据集如何根据序列信息重注释出全Gene symbol,基因序列转换为基因
04在一个矩阵中一个基因和其它基因的相关性,批量相关性分析
01单基因和免疫检查点的相关性
只需要一个mRNA,就能做cerna网络图。预测目标mrna基因结合的miRNA,mrna-mirna-lncrna
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孟德尔随机化常用数据库汇总
模型文章加分内容:列线图web网页计算器,根据患者的基因表达量和临床数据计算生存率。
TCGA,GEO等生信挖掘通用脚本,区分lncRNA和mRNA,区分蛋白和长链非编码RNA
物种小鼠】富集分析,GO和KEGG富集分析,生信分析
TCGA数据改版新版,新格式STAR - Counts,包含之前的count、fpkm数据,比老版本更好用,整理只需两步
新TCGA甲基化数据下载及处理方法,生信甲基化数据
GEO数据库单基因GSEA富集分析,生物信息
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02多基因和免疫检查点(或其它)相关性
用GPT4进行生信分析!(中英字幕)| 单细胞分析基本流程 | 单细胞注释 | 富集分析 | GO、KEGG
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