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IBD/IBE分析流程及绘图;mantel's test
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代码链接:https://pan.baidu.com/s/1pniXUKq4w3IaD3Fh_xPDbw 提取码:6078 文章链接: https://doi.org/10.1093/hr/uhad041 #绘图样式参考 参考教程: https://doi.org/10.1038/s41467-022-34206-8 #环境/地理距离计算方法
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利用plink对snp数据进行主成分分析(PCA);ggplot2绘制PCA图
利用R包ENMTools进行生态位一致性检验(identity.test),生态位分化分析
刀切法(jackknife)检验结果可视化;maxent运行结果;ggplot2;R语言
R语言入门与数据分析.R语言数据可视化.科技绘图.数据图表.R语言实战.R语言基础入门.生信.R安装
利用ggplot2绘制ROC曲线;基于maxent运行结果;ENM;SDM;物种分布模型;生态位模型
Maxent模型常用参数设置及参数含义解读
适生区分布作图&适生区面积统计
利用admixture进行群体遗传结构分析(留记录)
worldclim下载的未来气候数据分享及处理;CMIP6(BCC-CSM2-MR)_2.5
利用R包lfmm(潜在因子混合模型)来识别基因环境关联位点;基因环境关联分析(GEA)
利用R包PCAdapt检测离群位点;适应性位点
IBD的自然病程 你是属于哪一种的呢?
利用R包gradientForest进行梯度森林分析,分析对等位基因频率影响最大的环境变量(非线性模型)
此视频包含了大多数遗传结构地理分布图的绘制方法;R语言绘图添加自定义颜色;admixture/structure地理分布图绘制
利用arcgis绘制适生区分布中心偏移(质心迁移)图(分析实录),视频内容略显繁琐,细节不少
利用R语言提取物种分布点的19个气候数据,以及代码分享
末次盛冰期(LGM);全新世中期(MH);末次间冰期(LIG)原始数据分享,具体包含内容视频中有演示
1:25万、1:100万的湖泊、河流、流域、水系等数据的下载方式分享
名医面对面节目特辑(一) 什么是炎症性肠病IBD?
做一张好看的世界地图,横板图例(颜色和地图样式均选自高分论文)
克罗恩病患者能不能吃水果?
genemarker软件分享
基于arcgis,使用SDMtoolbox进行适生区收缩扩张(分析实录)
叶绿体基因组拆环/解环;getorganelle&SPAdes组装结果处理
maxent运行报错(have different geographic dimensions);有不同的地理维度
admixture图&系统发育树组合图制作
利用R包“terra”对未来气候数据进行拆分和提取,以BCC-CSM2-MR_ssp126_2061-2080为例
全国主要山脉及水系(1-5级)shp文件分享
利用R包LEA做遗传结构分析,速度比structure会快很多
利用excel做一张好看的柱状图,更直观去看不同时期适生区面积变化
利用R包(ENMeval)对maxent模型参数进行调优,视频演示及代码分享
组合地图制作(高分SCI必备),arcgis一键导出无需PS
利用arcgis绘制单倍型地理分布图&导入文件演示
maxent运行结果中响应曲线(Response curves)的绘制:SDM;ENM
物种分布模型(SDM)结果的地图颜色选取(对高水平文章的颜色进行模仿)
利用R包corrplot绘制热图,再使用AI进行聚类树和热图的组合
利用R语言进行冗余分析和偏冗余分析,RDA&偏RDA分析
叶绿体基因组比对工具Gepard;可以用来判断组装结果分区方向是否正确
名医面对面节目特辑(二)如何鉴别炎症性肠病IBD?
炎症性肠病患者:我可以找男/女朋友吗?