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【多组学】基因组和转录组整合分析案例
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培训目标: 1,短、平、快,为基金申请保驾护航,发表paper如虎添翼; 2,掌握多组学数据分析核心技能,GEO、TCGA、SRA数据处理没有压力; 3,科研绘图:以一敌百,高端大气,私人订制; 4,一套数据多角度演练,更易掌握分析思路。 主讲专家: 来自清华大学、上海交通大学、中国科学院等高校医学生物信息学学科带头人、擅长医学数据统计分析、多组学、生物医学大数据挖掘。发表数十篇专业领域内学术论文及SCI论文,主编或参与编写多部著作。参与多家三甲医院临床生物信息学的研究合作,科研及授课经验很丰富。 一、基因组学及生物信息学概述 1、基因组学与生物信息学背景知识介绍 2、生物信息进展与前沿技术介绍 二、组学技术介绍 1、基因组学 2、转录组学 3、表观组学 4、蛋白质组学 5、代谢组学 6、糖组学 7、脂组学 三、基因组学实验设计及数据分析 1、基因组重测序的理论与研究方法及意义 2、全基因组数据分析策略 3、全外显子组、目标区域测序策略与分析 四、转录组学实验设计及数据分析思路 1、转录组学研究的实验技术和分析基础 2、有reference转录组数据分析思路 3、无reference转录组数据分析思路 4、转录组数据分析演示 五、表观组学——DNA甲基化和RNA的联合分析 1、高通量表观遗传组学数据原理 2、DNA甲基化数据分析方法 3、DNA甲基化与转录组联合分析思路 4、零编程复现生物信息文章套路 六、表观组学——公共数据库及工具介绍 1、Chip-seq数据分析方法 2、表观组学公共数据库介绍 七、多组学数据整合分析思路介绍 1、基因组和转录组数据整合分析思路介绍: 1)基因组和转录组数据整合分析 2)miRNA-mRNA联合分析 3)组学数据与临床数据关联分析 4)基于多组学数据的分子分型 5)基于多组学数据的biomarker发现 2、基因组和转录组数据整合分析案例介绍 八、多组学数据分析实例演练 1、甲基化与表达谱关联分析 2、甲基化驱动基因分析 3、甲基化与转录组联合生存分析 4、miRNA的mRNA靶基因分析 5、miRNA的lncRNA靶基因分析 6、ceRNA网络构建 7、多组学与临床数据整合分析 8、多组学整合分析在线数据库 九、辅助课程 1.学后交流、微信群、QQ群建立; 2.咨询、合作。专业技术团队深入探讨。 联系人: 毛泽璇(老师) 手机(微信同号):15210196261 电话:010-56129268 官方咨询QQ:513692711 E_mail:cashq_ict@vip.163.com 网址: http://www.camec.org.cn 工业与信息化技术培训网:http://www.itcc.ac.cn 多组学分析应用QQ群号:730891030(加群备注:毛泽璇邀请)
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