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HelloBD 44 GeneMiner 2: 系统发育基因组学的一体化全流程分析工具(余岩)
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随着测序技术的不断发展,系统发育研究也进入到了基因组学时代。研究者可以获取的数据量成指数级增加,同时也面临许多挑战:(1)如何从转录组、重测序等数据中提取单拷贝核基因、细胞器基因等分子标记?(2)如何对海量的分子标记进行过滤和筛选,以获得可靠、稳健且富含系统发育信息的数据子集?(3)如何选择合适的分析流程来利用这些数据构建系统发育树、修订树时间等?为了解决这些问题,我们推出了GeneMiner 2,仅需输入二代测序数据,即可自动完成多种类型分子标记的系统发育重建流程。GeneMiner 2拥有用户友好的图形界面,与Windows操作系统兼容,无需进行繁琐的软件和环境配置。相比于Read2Tree、Hybpiper、OrthoFinder等工具,GeneMiner 2在构建系统发育树的过程中更为简便且可靠,对系统发育基因组学领域的发展具有重要的推动作用。
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