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e嘉医 | GEO数据挖掘：【20】专题四 富集分析-GO富集分析(二)
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GO富集分析代码以及结果解读 代码直接放在这里啦↓↓↓ GO <- enrichGO(gene = enrich_gene$ENTREZID, #输入数据entrez id OrgDb = org.Hs.eg.db, #注释信息 ont = "ALL", #term，BP/CC/MF pAdjustMethod = "BH", #校正方式 pvalueCutoff = 1, #pvalue的阈值 qvalueCutoff = 1, #qvalue的阈值 readable = TRUE) #是否将entrez id转换为symbol write.table(data.frame(ID=row.names(GO@result),GO@result), file = "GO_enrich_result.txt", sep = "\t", quote = F, row.names = F, col.names = T)
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