V
主页
京.东618红包,每天可领3次
利用TBtools软件「Blast Zone」和「Find Best Homology」工具一键构建进化树实现在全基因组水平进行特定物种同源基因鉴定的比较
发布人
「Blast Zone」和「Find Best Homology」工具均可在全基因组水平对特定物种中的同源基因一键构建进化树进行鉴定,教程中以拟南芥AthFT基因为查询对象,目的是鉴定Qu-1(来源于杨树),DH1-21(来源于杨树)和毛果杨中的FT同源基因,分别利用「Blast Zone」和「Find Best Homology」工具对Qu-1基因组中的FT同源基因进行鉴定并一键构建进化树,结果显示二者输出的结果一致,且Qu-1基因组中存在2个FT基因,随后利用「Blast Zone」工具对Qu-1(来源于杨树),DH1-21(来源于杨树)和毛果杨三个物种同时进行鉴定,发现均存在2个FT基因,此结果也与已有报道杨树中存在2个FT基因一致,「Blast Zone」工具最大的优势即是可以实现对多个物种进行同时鉴定。
打开封面
下载高清视频
观看高清视频
视频下载器
利用TBtools软件「The Best ID Converter」工具快速准确进行两个物种的基因ID转换
利用TAIR网站BLAST工具查找拟南芥同源基因
利用TBtools软件进行物种内共线性分析
利用TBtools通过HMMER方法鉴定家族成员
利用TBtools软件展示基因在染色体上的分布保姆级攻略
从NCBI下载物种的全基因组序列
NCBI CD-Search批量鉴定保守结构域并利用TBtools进行可视化
利用TBtools软件进行物种内共线性分析保姆级教程
利用TBtools软件展示基因在染色体上的分布
利用TBtools软件统计染色体长度的几种方法
通过TAIR网站批量查找拟南芥基因序列
利用TBtools软件Blast Zone和Two Sequence Files工具对物种全基因组进行Blast的比较
利用ImageJ批量添加标尺
利用TBtools软件「GXF Representative mRNA ID Select」工具对基因组代表性转录本集合进行提取
利用TBtools软件Batch SMART工具批量鉴定保守结构域
利用TBtools软件统计基因位置信息
利用iTOL网站进行进化树的美化
利用TBtools软件「Advanced Circos」工具进行染色体骨架的绘制
利用TBtools软件Find Best Homology工具在全基因组水平进行特定物种同源基因查找
利用TBtools批量计算蛋白质分子量、等电点、不稳定系数、脂溶指数和亲水指数
利用TBtools软件「Gene Density Profile」工具进行全基因组基因密度统计
利用TBtools软件一键构建最大似然树
利用在线工具进行两组及多组样本的t检验差异分析
利用In-Fusion技术进行基因克隆
基因家族分析前物种基因组文件的准备
利用TBtools高效去除基因组序列和注释碎片
利用TBtools进行物种全基因组某家族成员的比对
利用TBtools软件「GXF Stat」工具统计物种的Gene,mRNA,Exon,Intron,CDS和UTR信息
基因家族成员特性分析
利用TBtools软件「Representative GXF Obtain」工具对基因组代表性转录本集合进行提取
利用GraphPad Prism进行柱状图的绘制
转录因子家族的鉴定
利用TBtools将酵母双杂交筛库一代测序结果批量比对参考基因组
利用ESPript对多序列比对结果进行可视化
一代测序结果比对拟南芥数据库结果整理
Swiss-Prot数据集下载
PCR引物特异性检测
onlyfans订阅问题解决方案
保守Motif分析及可视化
酵母自激活现象截短试验设计