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51,(1)双样本孟德尔分析,gwas为暴露(gwas.mrcieu.ac.uk/),EBI为(GCST开头的数据 )结局。MR分析
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51,(1)双样本孟德尔分析,gwas为暴露(gwas.mrcieu.ac.uk/),EBI为(GCST开头的数据 )结局。MR分析. 01gwas.mrcieu下载 02gwas.mrcieu数据筛选,去除连锁不平衡 03EBI数据下载 04gwas为暴露,EBI为结局。MR分析
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【教程完结】中文核心,双疾病双向孟德尔随机化分析,本地GWAS数据新手也可拿捏,骨髓瘤和骨质疏松举例,半天完成数据分析,
36.473肠道菌群MR分析(文章少有创新),数据已经处理好,直接下载对应基本运行,两个小时出结果
41芬兰FinnGen数据快速下载和数据处理,孟德尔随机化。
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12.5分,731 免疫细胞表型与骨坏死之间的复杂因果关系:双向双样本孟德尔随机化分析
【2区7.3教程完】473肠道菌群作为中介,联合731免疫细胞的孟德尔随机化的分析,本地数据,批量中介分析。新手也可做出来
孟德尔随机化MR包安装教程,无删减,VariantAnnotation,gwasglue,TwoSampleMR
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本地筛选基因相关基因,EBI、芬兰、GWAS数据库本地方法,暴露因素eQTL,孟德尔随机化
教程,GWAS与eQTL相结合,进一步筛选疾病相关基因,肿瘤和非肿瘤都可,新方法筛选标志物
TCGA数据库又更新了,这次可以看样本病理组织切片数据
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批量孟德尔随机化,50000条gwasID,挂机筛选有联系的暴露因素和结局
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TCGA数据下载和整理,包括转录组数据(FPKM,COUNT,TPM),甲基化,突变,临床数据,生信数据库
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147. 用decode pQTL进行SMR分析
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数据取log2,表达值差别较大取LOG2,适用GEO,TCGA等,生信分析方法~
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04在一个矩阵中一个基因和其它基因的相关性,批量相关性分析
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