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高斯加速分子动力学(GaMD)- 方法发展及应用 - 王进安博士 | 钰沐菡 公益公开课
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王进安博士毕业于中国科学院上海药物研究所药物设计专业,目前在美国堪萨斯大学进行计算生物学和药物设计方面的研究工作,是分子动力学模拟软件AMBER的开发者之一。研究方向为增强型取样方法发展及其在生物大分子中的应用,主要针对新一代高斯加速分子动力学的优化和应用。为高效模拟多肽/蛋白和蛋白/蛋白的结合解离过程开发了Pep-GaMD和PPI-GaMD,实现了在毫秒级别的分子动力学模拟捕捉结合解离过程,取得了与实验值类似的解离和结合常数。 本次公开课,王进安博士对GaMD进行深入讲解,主要分享了如下三个方面的内容: 1.GaMD方法原理及其最新进展 2.GaMD在生物体系,尤其是膜蛋白中的应用研究 3.GaMD在药物设计方面的应用
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