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分子模拟——从算法到应用 第一讲 热力学初步
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分子模拟——从算法到应用 第三讲 从热力学、量子力学到分子力场
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分子模拟——从算法到应用 第二讲 统计力学初步
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分子模拟——从算法到应用 第五讲 蒙特卡洛模拟和Metropolis准则
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【中英字幕】分子动力学之相对自由能计算和增强采样（伞形采样、副本交换分子动力学REMD）简介
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MD模拟中的生物化学 第一讲 绪论 基础化学知识
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第六讲 伞形采样的原理和推导（附后续课程计划和PMF简介）
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【搬运】gmx/Amber分子动力学模拟 理论与实践课 2022 by Jose Nogueira等人 伞形采样 QM/MM模拟 氧化还原 吸收光谱
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第三讲 20种氨基酸的基本性质：手性，酸碱性，结构特点，相互作用
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【搬运】实操：蛋白配体复合物分子动力学模拟 NAMD VMD 分子对接 AutoDock Vina 蛋白和配体的准备、能量最小化
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【讲座】分子动力学中的自由能计算 by Chris Chipot 自由能微扰 NAMD软件使用
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第二讲 非键相互作用（静电相互作用，氢键，范德华力，疏水相互作用，π-π，卤键）
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分子模拟——从算法到应用 第四讲 周期性边界条件和非键相互作用的处理（截断，Ewald求和）
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BioExcel生物分子模拟暑期学校 2021 原理+实操 分子建模 整合结构生物学 分子识别 QM/MM 增强采样 自由能计算
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【中英字幕】院士讲座：分子动力学与药物发现&计算机辅助药物设计 by Andrew McCammon
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高等热力学和分子模拟课程 2018 by Prateek Kumar Jha 印度理工IIT Roorkey分校 物理化学 MC/MD模拟 自由能计算
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【中英字幕】分子细胞生物学课程 2021 by William J Belden DNA的复制、修复、转录，信号转导，细胞骨架，细胞周期，生物膜系统和物质运输
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【院士讲座】基于机器学习的从头算分子动力学 by Roberto Car and Michele Parrinello
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【中英字幕】犹他大学 研究生物理化学之热力学 by Michael Hoepfner 理想气体 实际气体/溶液 分子间相互作用 相变 平衡 系综 配分函数
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分子动力学模拟GROMACS常用的分析数据作图与轨迹查看
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【中英】分子生物物理学课程（讲座版）by Erik Lindahl from 瑞典皇家理工学院
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Materials Studio Forcite 热导率的模拟
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【入门/中英】分子动力学模拟及基于其构象的马尔可夫模型简介
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院士课程：杂环化学 2021 by Phil Baran from Scripps Institute 芳香杂环 合成与性质
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【分子模拟】Collective variables简介、操作教程和应用
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分子动力学模拟-第8讲-演示自编C++程序的操作（樊哲勇）
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【生物物理学】分子生物物理学课程-2021 中英文字幕 前200讲 by Professor Erik Lindahl（瑞典皇家理工学院）
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【搬运】PMX+GROMACS+BioExcel 蛋白-配体自由能计算理论+实操 分子动力学模拟
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今年诺贝尔化学奖跟GROMACS分子动力学有没有关联？PACKMOL/MS建模、VMD展示、拓扑文件构建、吸附、解离、聚集模拟教学
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【杜克大学】计算结构生物学课程 by Bruce R. Donald 蛋白质设计 NMR 蛋白动力学
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我终于搞明白了热力学的平衡态
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【中英】超详细易懂的分子建模教程（偏原理） 圣保罗大学 2015 分子力场各项详解 几何优化方法 分子动力学和蒙特卡洛模拟
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【讲座】分子开关：生物中的蛋白激酶& GTP结合蛋白的结构、功能和调控
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【中英字幕】可以练英语的生物化学课程之蛋白质简介2015 热力学和结构 分离纯化 测序分析 应用 （氨基酸、蛋白折叠；盐析、透析、SDS-PAGE、色谱）
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【搬运】中英 NAMD教程 蛋白/膜蛋白模拟 配体结合自由能 CHARMM-GUI配体参数化 novel residue VMD搭体系
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分子动力学模拟-第10讲-近邻列表初步（樊哲勇）
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【生物物理学】分子生物物理学课程-2021 英文字幕 后98讲 by Professor Erik Lindahl（瑞典皇家理工学院）
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分子动力学模拟-第9讲-模拟盒子（樊哲勇）
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【高中物理】冒死上传！！赶紧码住啦！2025黄夫人 【vip付费课程大合集】 全网最新最全
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分子动力学实操教程0.7 分子模拟是在模拟什么？
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分子动力学模拟-第7讲-分析由自编C++程序获得的结果（樊哲勇）