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生信是干啥的
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简单的介绍一下生信,以及测序的处理过程。 想看详细过程(下载数据,数据处理,mapping,下游分析),请关注一下,看我接下来的项目吧。 主要还是不清楚大家的情况?如果觉得需要讲某些东西,也可以留言。 我准备做的内容: 下载论文的原数据 基本的bash命令 (wc, grep, 方法, 变量, 循环) 使用conda/mamba 管理环境 前处理:fasqc, cutadapt mapping: 准备使用 HISAT2, 考虑STAR中 sam 文件格式,以及samtools的使用 使用 R 的 tidyverse 和 ggplot2 制作热力图 为啥这么糊啊?是Windows on ARM 的问题吗?下次提高码率吧,不想重新录了。
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