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GTEx联合TCGA数据库泛癌基因表达差异分析
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GTEx(Genotype-Tissue Expression,基因型-组织表达)数据库,研究从来自449名生前健康的人类捐献者的7000多份尸检样本,涵盖44个组织(42种不同的组织类型),包括31个实体器官组织、10个闹分区、全血、2个来自捐献者血液和皮肤的细胞系,作者利用这些样本研究基因表达在不同组织和个体中有何差异。 GTEx对几乎所有转录基因的基因表达模式进行了观察,从而能够确定基因组中影响基因表达的特定区域。 此外,合并GTEx与TCGA数据库数据能够有效解决TCGA数据库中正常组织样本量不足的缺陷,从而提高比较的准确性。 详细教程参考 GTEx联合TCGA数据库差异分析(更新) – 王进的个人网站 https://www.jingege.wang/2022/03/16/gtex%e8%81%94%e5%90%88tcga%e6%95%b0%e6%8d%ae%e5%ba%93%e5%b7%ae%e5%bc%82%e5%88%86%e6%9e%90/
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