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生物图像分析 2:预处理
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在这个 6 个视频系列中,Anne Carpenter 博士和 Kevin Eliceiri 博士提供了生物图像分析的概述。预处理是图像采集之后的第一步,它将通过降低信噪比、对图像应用适当的滤镜和颜色提取来准备图像。执行预处理后,您就可以进行分割,即识别图像中单个细胞或结构的过程。如果适合您的数据集,您可以使用跟踪来在空间和时间上链接对象并测量速度、方向性和细胞分裂。生物图像分析的最后一步是通过测量不同的特征来分析数据,例如细胞或生物结构的数量,或者它们的大小、形状、强度或纹理。 Carpenter 和 Eliceiri 通过提供有助于科学家正确分析数据的最佳实践技巧来完成本系列。 演讲者传记: 第一位演讲者:Anne Carpenter (Broad Institute) Anne Carpenter 是麻省理工学院和哈佛大学博德研究所的研究所科学家。 Carpenter 在伊利诺伊大学厄巴纳-香槟分校获得了生物科学学士学位和细胞生物学博士学位。她在麻省理工学院/怀特黑德生物医学研究所的 David Sabatini 博士实验室继续她的科学培训,并由麻省理工学院计算机科学/人工智能实验室的 Polina Golland 博士共同指导。 2017 年,Carpenter 在 Broad Institute 开设了她的实验室,在那里她结合了她在细胞生物学、显微镜和计算生物学方面的背景,开发了从生物图像中提取定量信息的方法。 第二发言人:Kevin Eliceiri(威斯康星大学麦迪逊分校) Kevin Eliceiri 博士是威斯康星大学麦迪逊分校医学物理和生物医学工程副教授兼光学和计算仪器实验室 (LOCI) 主任。 Eliceiri 在麦迪逊的威斯康星大学完成了生物技术和生物医学工程的学士和博士学位。 2008 年,他创立了 LOCI,并在威斯康星大学麦迪逊分校成立了他的研究小组。他目前的研究重点是开发用于研究细胞微环境在疾病中的作用的新型光学成像方法,以及开发用于多维图像分析的软件。
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