V
主页
京.东618红包,每天可领3次
GEO重注释,五分钟搞定一个芯片的重注释,让那些没有genesymbol的数据再次好用,GSE145733,GPL19395
发布人
GEO重注释,五分钟搞定一个芯片的重注释,让那些没有genesymbol的数据再次好用,GSE145733,GPL19395,我们做芯片数据分析的时候经常会遇到有些基因芯片根本没有geneSymbol,或者有些lncRNA芯片根本没有像样的名称,故此对我们后续的分析也造成了不少的麻烦,基于此 我们可以通过序列比对的方式将探针序列重新比对到转录本上,从而拿到最新的基因编号
打开封面
下载高清视频
观看高清视频
视频下载器
11GEO数据集如何根据序列信息重注释出全Gene symbol,基因序列转换为基因
TCGA数据下载处理,TCGA转录组数据,史上最简单最方便都能学会的方法
GEO数据不会整理?4个方法能整理好99%GEO数据集,有symbol直接转换,重注释,有GB-list,样本在RAW里
复现二区8.7分非肿瘤纯生信文章,再不上车来不及了,基于GEO数据库机器学习筛选特征基因,非肿瘤诊断标志物,生物信息学,可实验验证
数据取log2,表达值差别较大取LOG2,适用GEO,TCGA等,生信分析方法~
GEO数据库挖掘,非肿瘤疾病生物信息挖掘,精神分裂症举例
非肿瘤ceRNA调控网络,lncRNA-miRNA-lncRNA
GEO数据库单基因GSEA富集分析,生物信息
GEO单基因的差异分析,批量绘制单基因差异图。生信分析判断基因差异性
从TCGA数据库中,筛选出和预后相关的所有基因。没有目标基因方法,找到新课题
16GEO数据库limma包差异分析得火山图和热图,GEO数据库差异分析
AutoDock分子对接
GEO数据整理,单独样本文件整理,RAW单独文件处理方法
生物信息,生信文章,简单粗暴复现5分文章生信内容,非编码RNA结合临床预后生信分析思路,列线图差异分析ROC模型构建TCGA
基于GEO数据集,非肿瘤疾病生信分析挖掘基因,模仿3分SCI文章基础上增加创新型,分子对接,单个数据集阿尔兹海默症举例
基于GEO数据集,非肿瘤疾病生信分析挖掘基因,模仿3分SCI文章基础上增加创新型,分子对接,单个数据集阿尔兹海默症举例
TCGA数据差异分析,绘制火山图并标注感兴趣的基因,结肠癌coad差异分析
二区8.7分纯生信SCI,非肿瘤诊断标志物,基于GEO数据库包含机器学习免疫浸润,清清爽爽
矩阵中两基因之间的相关性,标注P值和R值。皮尔逊相关性方法,分享代码和示例文件
IF分4.2,当孟德尔随机化遇上生信擦出的火花,基于GEO数据库的非肿瘤生信分析,WGCNA+孟德尔分析筛选疾病的关键基因
在线富集分析metascape,可做任何物种,无代码只要有手就行,结果包含KEGG,GO(BP,CC,MF)等,基因功能注释分析工具,
下载某一条通路的所有基因名字KEGG
04在一个矩阵中一个基因和其它基因的相关性,批量相关性分析
黄河见底
【教程】Q2区5分,非肿瘤双疾病生信分析+孟德尔,简单思路差异基因富集分析,PPI蛋白网络,筛选核心基因快速发文
地理动画 地理八分钟 世界地理 中国地理给孩子的万物说明书,用地理解决孩子的人文启蒙困境~有题目可巩固
央视推荐🔥让孩子知识暴涨的50集地理纪录片🎦适合3-15岁朋友观看
生信文章SCI新思路,Q1区5分思路,m7G RNA调控因子在肿瘤中的表达和预后价值,m7G新热点,同时可做m5C,代谢,脂肪酸代谢,氧化应激,焦亡坏死等通路。
TCGA数据库中筛选预后相关的基因,及单基因简单分析
ICGC数据下载和整理
生信分析,TCGA数据库中,基因在乳腺癌分型的表达,TCGA三阴性乳腺癌数据
TCGA数据下载和整理,包括转录组数据(FPKM,COUNT,TPM),甲基化,突变,临床数据,生信数据库
Cytoscape 绘图,相互作用网络显示了药物的核心生物靶点、药理功能和信号通路
GTEX联合TCGA数据,TCGA中只有疾病样本,没有正常样本或正常样本少
【文章全套教程】Q1区,肠道菌群和糖尿病:双样本孟德尔随机化研究,5.7分,如何靠孟德尔随机化肠道菌群秒上5分?生信分析
基于TCGA数据库,构建ceRNA(竞争性内源RNA),R语言下载数据,外部数据预测。生物信息
kegg和go富集分析,只有基因列表无logFC值,拒绝No gene can be mapped...
【教程】一小时复现1区7.3分孟德尔随机化数据,肝硬化和银屑病之间潜在的因果关系原数据,赶紧上车。
很多过来人都后悔了!大学工科里最累最难学的5个专业,光这一个就能劝退96.99%的人!