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iMeta | 康奈尔大学郭春君组开发非模式肠道菌基因编辑工具
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iMeta | 康奈尔大学郭春君组开发非模式肠道菌基因编辑工具 非模式肠道菌基因编辑工具 Genetic manipulations of nonmodel gut microbes DOI:https://doi.org/10.1002/imt2.216 发表时间:2024年6月23日 第一作者:金文兵 通讯作者:金文兵(wej4002@med.cornell.edu)、郭春君(cj@guo-group.org) 主要单位: 康乃尔大学医学院 吉尔·罗伯茨炎症性肠病研究所 康乃尔大学医学院 弗里德曼营养和炎症中心 亮点 • 此实验方案介绍了一系列详细的基因编辑工具相关的实验步骤,助力研究非模式肠道共生菌所编码基因的功能; • 此方案可在基因组信息未知的情况下,在非模式肠道拟杆菌和梭菌属中建立基因编辑工具; • 此方法为人体肠道菌的基因编辑工具提供高通量的筛选和建立方案。 摘要 健康人与患病人类之间有诸多微生物基因的表达存在显著差异。许多基因由非模式肠道共生菌编码,且这些基因难以进行基因操作,这是阻碍我们研究这些基因如何影响宿主生物学/疾病的分子机制的瓶颈所在。建立有效的基因转移方法并开发其基因编辑系统,将助力我们研究非模式肠道共生菌影响宿主生理的分子机制。本文介绍了一系列详细的基因编辑工具相关的实验步骤,针对非模式肠道革兰氏阴性拟杆菌和革兰氏阳性梭菌建立有效的基因转移方法并开发其基因编辑系统。通过靶向细菌16S rRNA或扩增梭菌可兼容的复制起点,结合CRISPR基因编辑系统,此方案可在基因组信息未知的情况下,在非模式肠道拟杆菌和梭菌属中建立基因编辑工具。此高效且通用的策略将助力肠道共生菌影响宿主生理功能的机制研究。
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