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机器学习与热力学之联袂:通向精确pKa预测之路 -- 罗伟梁
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pKa 预测旨在描述未知分子的酸碱性质和质子化状态,在药物设计中对于ADME/T性质优化和准确的构效关系评估十分关键。比传统的分子性质预测任务更复杂的是,药物化学场景常常涉及多个电离位点酸碱反应的相互耦合,其中精确而自洽的pKa 预测仍是亟待解决的困难。 本期演讲者罗伟梁与深势科技团队中的合作者融贯分子大模型预训练技术和热力学原理,提出了 Uni-pKa 预测框架。这一框架基于“质子化系综”理论建模复杂的酸碱反应网络,通过化学信息学工具严格解读实验数据集,采用分子表示学习模型Uni-Mol预测质子化状态的自由能来实现酸碱平衡中的多个预测任务,通过专门设计的预训练-精调策略达到了与量子化学方法媲美的精度。本期公开课将介绍 Uni-pKa 的理论背景和算法设计如何系统地解决复杂分子 pKa 预测问题,希望为基础科学原理和机器学习的有机结合提供启示。 罗伟梁,麻省理工学院化学系博士生,师从 Heather J. Kulik 教授。本科期间在深势科技担任实习算法研究员时完成相关工作,并发表在《JACS Au》期刊上。
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