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孟德尔随机化-R语言编程中常见的错误
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孟德尔随机化临床医学SCI培训班【2023年09月15日-18日】 利用孟德尔随机化方法撰写论文,这几年越来越火热。因为基因和疾病之间的关联不会受到出生后的环境、社会经济地位、行为因素等常见混杂因素的干扰,且因果时序合理,使效应估计值更接近真实情况。所以,这是一种相对快速、简单的一种论文撰写方式,不用自己收集数据,利用公共数据库,但却往往能发表高分研究成果。 首先孟德尔随机化只是一根数据分析的工具,所以不要恐惧其字面意思。 这是一种借助于公共数据据开展、不需要花大精力的论文分析与写作方法。 找到好的主题,数据分析方法很简单,两周成文章,而且不需要掌握复杂的统计学方法。 每个临床科研方向都可以找到相应疾病,相应的因素来开展论文写作。 入门上手很快,成为临床医生首选发表SCI高效技能。 一、培训目标: 1,掌握孟德尔随机化的基本原理,基本概念、基本假设和检验方法,特别是全基因组关联研究(GWAS)、工具变量等基本概念; 2,以已经发表的孟德尔随机化论文为导向,让学员掌握孟德尔随机化在R中的操作步骤; 3,如何利用现有的孟德尔随机化文章和公开可获得的数据,形成SCI论文的写作思路; 4,通过系统的学习与实战演练,能独立完成此类SCI论文的撰写和发表。 二、课程大纲 (一)、知识准备 1,孟德尔随机化基本知识介绍 2,孟德尔随机化方法的基本原理与方法 3,全基因组关联研究、工具变量、MR基本假设介绍 4,利用孟德尔随机化方法撰写论文的关键过程 5,孟德尔随机化数据的数据结构、来源与下载 6,如何利用相关网络资源进行孟德尔随机化数据分析 7,重量级文献导读 8,答疑 (二)、R和R Studio软件实操应用 1,R语言的对象(向量,因子,数据组和数据框)的生成规则和具体使用方法;数量型,分组型和逻辑型数据的处理和操作方法 2,数据的读取,清洗和整理 3,生成数据和数据分布分析 4,数据描述性分析及基本作图 5,模型构建和分析预测(线性,非线性,logistic回归模型)以及高级制图 6,孟德尔随机化方法R语言方法的基本入门知识 7,结合案例通过R语言开展孟德尔随机化方法数据分析 8,答疑 (三)、孟德尔随机化实战(一) 1,孟德尔随机化选题指导 2,孟德尔随机化暴露和结局数据库的获取 3,R软件读取大型暴露与结局数据库 4,工具变量的筛选流程 5,混杂的处理 6,答疑 (四)、孟德尔随机化实战(二) 1,获取结局SNP 2,孟德尔随机化主要结果的实现 3,孟德尔随机化敏感性分析 4,孟德尔随机化散点图、森林图等结果可视化的实现 5,答疑 (五)、多变量、中介孟德尔随机化研究 1,什么是多变量随机化研究 2,4个R包完成6种多变量孟德尔随机化分析 3,计算多变量SNP的统计量 4,多变量孟德尔随机化敏感性分析 5,什么是中介孟德尔随机化研究 6,中介孟德尔随机化的两种假设 7,总效应已知与总效应未知 8,两种检验方法;逐步检验与系数乘积法; 9,各种情况下结论的总结 10,答疑 (六)、创新MR方法介绍与答疑 1,汇总结果整理指导 2,孟德尔随机化写作指导 3,创新孟德尔随机化方法介绍 4,如何撰写规范的孟德尔随机化应用论文 5,绍复杂孟德尔随机化高级方法与应用 6,结合ChatGPT来辅助论文写作的过程与技 7, 答疑 (七)、辅助课程 1.学后交流、微信群、QQ群建立; 2.咨询、合作。专业技术团队深入探讨。 三、咨询 联系人: 李文娜(老师) 手机(微信同号):13311241619 工业与信息化技术培训网:http://www.itcc.ac.cn 医学生物信息学QQ群号:876726523(加群备注:李文娜邀请)
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