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小白教程10.3:薅云服务器羊毛之安装Gromacs (2023.2, fftw+GPU)
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登录云服务器,并以root用户身份在根目录安装Gromacs(2023.2,fftw + GPU) ssh -l 用户名 -p 22 xxx.xxx.xx.xx 登录服务器 gcc --version g++ --version sudo su #登录root用户 #安装Gromacs wget ftp://ftp.gromacs.org/pub/gromacs/gromacs-2023.2.tar.gz tar -zxvf gromacs-2023.2.tar.gz cd gromacs-2023.2 mkdir build cd build cmake .. -DCMAKE_INSTALL_PREFIX=/gmx-2023.2 -DGMX_BUILD_OWN_FFTW=ON -DGMX_GPU=CUDA -DCUDA_TOOLKIT_ROOT_DIR=/usr/local/cuda make -j 8 make install #root用户配置 nano ~/.bashrc ~/.bashrc写入:source /gmx-2023.2/bin/GMXRC control + x,y,回车 exit #登出root用户,回到普通用户 #普通用户配置 nano ~/.bashrc ~/.bashrc写入:source /gmx-2023.2/bin/GMXRC control + x,y,回车 exit #登出云服务器 ssh -l 用户名 -p 22 xxx.xxx.xx.xx #重新登录服务器 gmx -h #检查普通用户能否调用Gromacs sudo su gmx -h #检查root用户能否调用Gromacs rm -rf gromacs* #root用户权限下删除Gromacs安装文件(普通用户权限下删除不了解压缩目录) exit
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