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14,GEO数据库数据处理,有基因名字,基因symbol
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在进行GEO数据库数据处理时,基因名字(gene name)和基因符号(gene symbol)是关键的注释信息。
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11GEO数据集如何根据序列信息重注释出全Gene symbol,基因序列转换为基因
kegg和go富集分析,只有基因列表无logFC值,拒绝No gene can be mapped...
GEO数据不会整理?4个方法能整理好99%GEO数据集,有symbol直接转换,重注释,有GB-list,样本在RAW里
GEO数据下载及处理,史上最简单的方法,无代码,含gene symbol类型GPL570
非肿瘤ceRNA调控网络,lncRNA-miRNA-lncRNA
20从矩阵提取目标基因(研究基因)集合
【教程】Q2区5分,非肿瘤双疾病生信分析+孟德尔,简单思路差异基因富集分析,PPI蛋白网络,筛选核心基因快速发文
【文章教程】7.4分 多GEO数据库+eQTL孟德尔分析,筛选单基因。基因集为暴露因素,GEO+孟德尔共同筛选疾病基因。脓毒症生信+eQTL孟德尔分析
教程,GWAS与eQTL相结合,进一步筛选疾病相关基因,肿瘤和非肿瘤都可,新方法筛选标志物
GEO单基因的差异分析,批量绘制单基因差异图。生信分析判断基因差异性
HPA数据库下载免疫组化原始图片,不是截图,https://www.proteinatlas.org/
复现二区8.7分非肿瘤纯生信文章,再不上车来不及了,基于GEO数据库机器学习筛选特征基因,非肿瘤诊断标志物,生物信息学,可实验验证
只需要一个mRNA,就能做cerna网络图。预测目标mrna基因结合的miRNA,mrna-mirna-lncrna
【文章全套教程】IF分4.2,非肿瘤and孟德尔随机化加持,基于GEO数据库的非肿瘤生信分析,WGCNA+孟德尔分析筛选疾病的关键基因
新TCGA甲基化数据下载及处理方法,生信甲基化数据
下载某一条通路的所有基因名字KEGG
5分TCGA单基因生信分析思路,没有课题创造课题,新版TCGA数据库筛选预后基因方法及单基因分析,实验前预分析
芬兰FinnGen数据下载和数据处理,孟德尔随机化。
【教程】Q1区7.3分。孟德尔联合生信分析。 基于孟德尔随机化和转录组数据分析,探索非肿瘤在肿瘤中的因果关系和发病机制。
GEO数据库单基因GSEA富集分析,生物信息
GEO数据整理,单独样本文件整理,RAW单独文件处理方法
肿瘤单基因可做的生信分析,TCGA数据库肿瘤单基因分析
TCGA数据下载和整理,包括转录组数据(FPKM,COUNT,TPM),甲基化,突变,临床数据,生信数据库
GEO重注释,五分钟搞定一个芯片的重注释,让那些没有genesymbol的数据再次好用,GSE145733,GPL19395
生信富集分析,GO(BP,MF,CC),KEGG,功能富集分析的基因功能数据库及软件,生物信息
GEPIA和Kaplan-Meier Plotter 在线网站使用,单基因TPM,单基因差异,单基因生存曲线
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生信分析,TCGA数据库中,基因在乳腺癌分型的表达,TCGA三阴性乳腺癌数据
数据取log2,表达值差别较大取LOG2,适用GEO,TCGA等,生信分析方法~
【教程完】双数据库做药物靶点孟德尔,本地数据。乳腺癌为例。eqtl+gwas训练+芬兰验证+药物分子对接+共定位+ PheWAS+蛋白互作PPI+富集分析
01 单基因的生存曲线ROC曲线,TCGA数据库,代码评论区直接下载
05(附代码)GEO数据下载与整理,保姆级教程,带你零基础学生信,一键整理GEO数据与临床样本数据
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TCGA数据库又更新了,这次可以看样本病理组织切片数据
PrognoScan,生存分析信息最全面的数据库,可以查找在GEO数据库中某基因在泛癌中的生存预后情况
基于TCGA数据库,构建ceRNA(竞争性内源RNA),R语言下载数据,外部数据预测。生物信息
【教程】一小时复现1区7.3分孟德尔随机化数据,肝硬化和银屑病之间潜在的因果关系原数据,赶紧上车。
孟德尔随机化方法筛选出疾病相关基因,本地运行芬兰数据库,没有基因的可寻找研究基因方法。
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