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CGM第421期-张童童-DNA转座子多样性研究和应用开发
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自1948年Barbara McClintock首次报道转座子以来,这类跳跃遗传元件对宿主演化的重要意义逐渐被揭示。其中,DNA转座子作为主要类型之一,长期以来备受关注。然而,由于以往多为个案研究,DNA转座子活性的决定因素与进化模式的一般规律尚不清晰。尽管DNA转座子可作为基因工程工具用于插入诱变或转基因载体,但目前只有Sleeping Beauty(SB)等少数几种转座子得到了开发和广泛应用。因此,系统挖掘具有不同功能特点的转座子工具亟待开展。 在该项研究中,基于102个后生动物基因组,我们筛选到40个在人源细胞中具有转座活性的新型DNA转座子,系统解析了DNA转座子的活性相关因素和进化动态。这些具有不同功能特点的转座子拓展了相关基因工程工具箱;尤为重要的是转座子Mariner2_AG(MAG)在CAR-T免疫治疗实验中展示出高活性,具有临床应用价值。该研究基于自然界的动物遗传多样性开展了迄今为止最大规模的DNA转座子活性筛选,获得了目前最大的活跃DNA转座子数据集。这不仅揭示了与转座活性相关的进化因素和功能特征,还扩展了基于DNA转座子的遗传工具箱。
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