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快速精准的配体三维形状筛选算法 StarDrop eSim3D的原理,功能和全新应用
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随着蛋白结构预测技术的发展,基于受体结构的药物设计变得愈发可及。然而,考虑到蛋白结构预测算法的精度上限以及基于结构的设计对受体结构模型的精度要求,直接使用预测的蛋白结构模型仍然面临诸多挑战。 基于配体形状或三维构象的筛选策略与基于结构的药物筛选并驾齐驱,在缺少高精度受体结构信息时,能够很大程度地和基于结构的设计方法互补,从而实现更准确的筛选。此外,基于配体形状的筛选往往具有更快的速度,对计算性能要求也更低,可以实现on-the-fly模拟。 我们将在视频中介绍StarDrop中基于配体形状筛选的模块:eSim3D模块的算法原理、功能特点和全新特征。同时,我们还将演示eSim3D全新的虚拟筛选功能,您将见证eSim3D模块在极短时间内的大规模分子库筛选特性。 在本条视频教学,您将了解: ◈ eSim3D模块的科学基础; ◈ eSim3D方法的应用,包括:基于配体三维结构的虚拟筛选;构象生成;多配体叠合。 ◈ eSim3D全新虚拟筛选功能介绍及演示。
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