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CPTAC蛋白组学数据库介绍及数据下载分析
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Clinical Proteomic Tumor Analysis Consortium (CPTAC) 是一项National Cancer Institute在2011年发起的旨在利用大规模蛋白组和基因组分析,系统的鉴别源自癌症基因组改变和相关生物过程的蛋白质,加速对癌症分子机制研究,提升人们诊断,治疗和预防癌症水平的项目。 CPTAC包括基因组数据和蛋白组数据。基因组数据包含总计1300+不同类型肿瘤病人的WGS,WES和RNAseq数据,可通过GDC Data Portal访问。蛋白组数据可通过PDC 访问。CPTAC可查看和分析不同肿瘤类型的基因表达情况和基因在不同肿瘤类型的表达情况,发现潜在的标志物或靶点。
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