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CPTAC蛋白组数据下载可视化绘图小程序分享
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这两天抽空做的小程序,前面视频分享已经讲过如何下载CPTAC数据库数据,为了芳年大家使用,我已经下载整理好大部分的蛋白组数据,上传到我的服务器。做了个Shiny app进行数据提取和简单可视化,希望对大家有用。对于小程序中可视化的代码其实和我网站上TCGA可视化代码差不多,有点基础都是可以直接修改的,如果需要改好的,几块钱意思一下,在我的简介那边有网址。
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小程序分享TCGA miRNA成熟体和茎环结构数据下载及差异分析
工具分享:TCGA转录组数据合并+基因差异表达分析+火山图绘制
基于clusterprofiler包制作的shiny app用于富集分析可视化操作
TF-Target Finder: 转录因子-靶基因预测工具重磅升级
PCAS:利用CPTAC蛋白组学数据进行多组学癌症研究的R包及Shinyapp
小程序分享TCGA突变maf数据下载整合及分组瀑布图绘制和TMB计算
GEO数据集下载 & limma包差异分析 & 交集基因取交集 & Venn图
STRING网站+Cytoscape软件制作精美蛋白互作网络图(PPI)
GTEx联合TCGA数据库泛癌基因表达差异分析
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如何用字母标记法标注多重比较的显著性结果 ——Graphpad & R语言
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