V
主页
TCGA泛癌分析之单基因免疫细胞浸润相关性分析及可视化
发布人
肿瘤组织不是单纯的只包含肿瘤细胞,它是由各种不同类型的细胞组成的,其中就包含基质细胞,成纤维细胞,还有免疫细胞等,这些细胞就构成了肿瘤的微环境。 我们比较关注的是免疫细胞在这微环境中的作用。免疫细胞又包括很多种,如 B 细胞,T 细胞等。不同的免疫细胞在肿瘤发生过程中发挥不同的作用,而不同肿瘤的免疫细胞组成也各有特点。 因此在研究肿瘤发生,治疗等机制时,常常会对不同肿瘤类型的免疫细胞进行定量研究。所谓的定量研究就是研究不同免疫细胞的比例。 为了准确的评估肿瘤微环境中免疫细胞的构成,我们可以通过很多方法从 RNA 测序数据中量化肿瘤浸润的免疫细胞,比如 ssGSEA, Cibersoft, TIMER, EPIC 等. 本分享是分析单基因表达与各种免疫细胞浸润的评分的相关性以及可视化, 相关代码可以从此处获取: B站代码获取 – 王进的个人网站 https://www.jingege.wang/bilibili-code/
打开封面
下载高清视频
观看高清视频
视频下载器
【文章全套教程】5分TCGA单基因生信分析思路,生信+实验,适用于SCI,中文核心,毕业论文,多文章分析单基因都可以做什么。单基因筛选和分析
TCGA泛癌分析R语言教程:两个基因表达相关性分析及可视化
免疫浸润分析
TCGA免疫细胞浸润
单基因的免疫浸润分析,CIBERSORT方法
Cibersort免疫浸润,在线网站一键出结果
【零代码生信分析小工具】单基因泛癌免疫浸润分析,只需输入基因,一键分析成图,可真的太简单了!
40.基因与免疫功能免疫细胞相关性分析
TCGA单个基因甲基化与表达相关性分析
肿瘤单基因发文思路拆解—干湿验证结合+免疫细胞浸润,快来围观!
JCR一区生信文章,带你复现并超越它(附代码)(1)|TCGA数据处理 estimate免疫评分 生存分析|生信分析|R语言
怎么写国自然标书?7分纯生信文章:CDC161的泛癌分析,一个潜在的新免疫检查点
泛癌分析之拷贝数变异及表达相关性分析
0代码复现5分+非肿瘤文章:综合分析鉴定皮肌炎患者心肌损伤与免疫细胞浸润相关的关键生物标志物
0代码复现免疫细胞浸润分析!还有这种好事?有这个网站就够了!绝了绝了
GTEx联合TCGA数据库泛癌基因表达差异分析
2个月接收的5分+文章!单基因+泛癌分析+免疫浸润,搭配实验验证,思路清晰,轻松复现!
ssGSEA分析免疫细胞浸润分析(TCGA样本)
免疫细胞浸润分析(Cibersort法),以GEO数据为例,R语言实现与可视化
5分钟教你学会免疫浸润分析 | ssGSEA | TME分析 | 肿瘤免疫浸润微环境分析
单基因GSEA富集分析R语言教程:预测某个基因相关的生物学功能和信号通路
TCGA泛癌分析之单基因cox分析及森林图绘制 & 生存曲线批量绘制
【生信热点】单基因生信分析,单基因泛癌分析,单基因差异分析重难点梳理与总结
TCGA泛癌分析之基因转录本差异分析及热图可视化 & 转录本结构可视化
ssGSEA单样本基因集富集分析,免疫细胞浸润分析的另一种方法
免疫细胞浸润分析(xcell法),以TCGA数据为例,R语言的实现过程
R语言批量相关性分析及可视化:鉴定候选靶基因与特定表型基因表达的相关性
生信分析发SCI教学 14.免疫浸润【医学生必看】
TCGA泛癌分析之免疫检查点基因相关性分析及可视化(可用于其它基因集的相关性分析)
TCGA数据库,肿瘤单基因的免疫浸润,单基因分析的加分点
TCGA泛癌分析之单基因甲基化水平差异及表达相关性分析及可视化
基因与免疫细胞相关性热图
GEO数据集下载 & limma包差异分析 & 交集基因取交集 & Venn图
TCGA泛癌分析之配对样本T检验及批量绘制boxplot箱式图
目标基因与免疫细胞浸润分数(比例)的相关性棒棒糖图
工具分享:TCGA转录组数据合并+基因差异表达分析+火山图绘制
TCGA泛癌分析之单基因GSEA富集分析及可视化
基因与免疫细胞相关性热图--2(添加显著性P值,ggplot绘图)
文献精读04|单基因结合免疫浸润的新思路
小程序分享TCGA突变maf数据下载整合及分组瀑布图绘制和TMB计算